Распад СФР Југославије утицао је и на Спомен-подручје Јасеновац. Некада јединствен Меморијал подијељен је на два дијела: Спомен-подручје Јасеновац у Републици Хрватској и Спомен-подручје Доња Градина у Републици Српској, Босна и Херцеговина. Правни статус Спомен-подручја Доња Градина рјешен је 1996. када је Народна скупштина Републике Српске донијела Закон о Спомен-подручју Доња Градина. Тек 2002. године основана је Јавна установа „Спомен-подручје Доња Градина“ са циљем да чува успомену на жртве Концентрационог логора Јасеновац, да истражује и научно презентује усташки злочин геноцида у логору Јасеновац и Независној Држави Хрватској, да одржава простор Меморијала. 2020. године Спомен-подручје Доња Градина има 13 запослених, подијељених у неколико служби.